코룸3 다운로드

CORUM 데이터는 탭으로 구분 된 XML 파일 형식으로 다운로드할 수 있습니다. 단백질 복합체의 다운로드 버전은 정기적으로 업데이트 됩니다. 전체 데이터 집합 옆에 있는 CORUM은 개별 검색에 의해 생성 된 하위 집합의 다운로드를 제공 합니다. PSI-MI 2.5 또는 탭으로 구분 된 형태로 다운로드 하기 위한 각 버튼은 웹 페이지에서 사용할 수 있습니다. 새로운 CORUM 릴리스는 복잡 한 하위 단위 간의 추정 상호 작용을 검사할 수 있는 옵션을 제공 하기 위해 알려진 PPI 정보를 통합 하는 그래픽 도구를 제공 합니다. 단백질-단백질 상호 작용의 큰 공개적으로 이용 가능한 수집은 다른 자원에 게 서 데이터를 포함 하는 본래 데이터베이스에 의해 제공 됩니다 (31). CORUM 도구에 대 한, 우리는 ` 물리적 연관 `을 사용 하 여-그대로의 상호 작용, 릴리스 05 11 월 2018, 생물 호모 사피엔스, Rattus norvegicus와 머 무 컬 스. PPI 정보의 가장 큰 분 율은 호모 사피엔스 (238 841 항목), 마우스 (15 138) 및 쥐 (3962)에 의해 얻어진 다. 또 다른 주석이 달린 기능은 단백질 복합물이 유래 하는 유기 체입니다. 인간의 생물학을 향한 많은 연구 활동의 농도는 CORUM의 인간 단백질 복합체의 높은 함량에 의해 반영 됩니다.

CORUM에서 분석 된 모든 단백질 복합체의 대다수는 인간 (65%)에서 유래 하 고 마우스 뒤에 (14%) 및 쥐 (14%). 마디 나 아시, 줄리안 라인하르트, 바바라 브라운, 기 셀 라 Fobo, 고아 한 프리 쉬 먼, 코리 나 Montrone, 안드레아스 루epp, 코 럼: 포유류 단백질 복합체의 포괄적 인 자원-2019, 핵 산 연구, 47, 문제 D1 , 8 1 월 2019, 페이지 D559-D563, https://doi.org/10.1093/nar/gky973 포유류 단백질 복합체의 고품질 데이터 세트를 제공 하기 위해, 모든 엔트리는 수동으로 생성 된다. 격리 되 고 신뢰할 수 있는 실험 증거가 특징만 단백질 복합체 CORUM에 포함 되어 있습니다. CORUM에 대 한 고려 될, 단백질 복합체는 하나의 분자로 분리 되어야 하 고 여러 실험에서 파생 된 구성 되지 않아야. 또한, 하위 복합체의 인공 구조는 고려 되지 않습니다. 높은 처리량 실험의 정보에는 거짓 긍정 결과의 상당 부분이 포함 되므로 이러한 유형의 데이터는 제외 됩니다. 관련 논문에 대 한 참조는 주로 일반 검토 기사, 분석 문학 내 관련 단백질 복합체에 대 한 상호 참조 및 UniProt (12)에서 참조 된 기사에 대 한 의견에서 발견 되었습니다. 표 1은 사용 된 기사의 가장 높은 분 율이 생물학적 화학 저널 (23.6%), 분자 및 세포 생물학 (6.1%)에 7.1 의해 출판 된 것을 보여준다. 및 세포 (5.7%).

사용 된 기사의 대다수는 고 영향도 요인이 있는 일지에서, 단백질 복합물의 특성화는 중요 한 정보로 간주 된다는 것을 보여줍니다.